Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms