Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3AO14802 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms