Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRPO00253 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRPO00253 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms