Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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USP17L12C9JPN9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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