Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms