Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms