Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVV-2B6SEH9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms