Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms