Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms