Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM35Q9UPQ4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM35Q9UPQ4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM35Q9UPQ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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