Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms