Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIZ1Q9ULV3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIZ1Q9ULV3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms