Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms