Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms