Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms