Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms