Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms