Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms