Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STAMBPL1Q96FJ0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms