Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC1Q96C34 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms