Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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