Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms