Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms