Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNBP2Q8WZ74 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms