Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms