Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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