Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms