Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM35BQ8NCS4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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