Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM71DQ8N9W8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71DQ8N9W8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71DQ8N9W8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM71DQ8N9W8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FAM71DQ8N9W8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FAM71DQ8N9W8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FAM71DQ8N9W8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FAM71DQ8N9W8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FAM71DQ8N9W8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FAM71DQ8N9W8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FAM71DQ8N9W8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FAM71DQ8N9W8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FAM71DQ8N9W8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FAM71DQ8N9W8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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