Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAAF3Q8N9W5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms