Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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