Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARP9Q8IXQ6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP9Q8IXQ6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms