Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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