Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFVQ71UI9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms