Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q71RC1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q71RC1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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