Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4L3Q6VB84 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms