Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms