Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PXDC1Q5TGL8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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