Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHYHD1Q5SRE7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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