Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGO1Q5FBB7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGO1Q5FBB7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGO1Q5FBB7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGO1Q5FBB7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGO1Q5FBB7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGO1Q5FBB7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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