Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms