Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGL3Q3MIN7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGL3Q3MIN7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGL3Q3MIN7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGL3Q3MIN7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGL3Q3MIN7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms