Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms