Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms