Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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