Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms