Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT16Q17RD7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT16Q17RD7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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