Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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