Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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