Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NTRK2Q16620 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NTRK2Q16620 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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